北京医院协会由北京地区的各级医疗机构和医院管理者联合发起，于1996年3月经北京市社会团体登记管理机关核准登记的非营利性社会团体、独立法人单位。

　　北京医院协会会员单位包括北京地各系统医疗机构120多家，其中以二、三级医院为主。北京医院协会目前有分支机构27个（包括2个直属专业管理机构）：城市医院委员会、农村医院委员会、民营医院委员会、医政管理分会、门急诊管理分会、药事管理专业委员会、维护医院权益与卫生法律咨询专业委员会、医院行政管理专业委员会、医院医疗保险管理专业委员会、医疗管理科学专业委员会、临床实验室管理专业委员会、临床药师管理培训中心、医院远程医学管理专业委员会、医院经营管理专业委员会、医院社会工作管理专业委员会、医院管理与发展专业委员会、医院评价管理专业委员会、医院文化传播管理专业委员会、医院护理管理专业委员会、医院感染管理专业委员会、医院信息管理专业委员会、全科医疗管理专业委员会、医院日间手术管理专业委员会、医院康复医学管理专业委员会、医院静脉血栓栓塞症防治管理专业委员会、健康促进与健康教育专业委员会、医院党建研究专业委员会。

　　北京医院协会的宗旨是:团结北京地区各级各类医疗单位和医院管理工作者，贯彻卫生工作方针政策,深化医药卫生体制改革，加强医院的行业管理，促进医院与医院、医院与社会各界联系、协作；维护会员单位的合法权益；促进医院的现代化建设和科学管理，促进医院管理学科的发展；更好地为首都人民健康服务，为北京地区建设具有中国特色社会主义医疗卫生事业服务。本会遵守宪法、法律、法规和国家政策，遵守社会道德风尚,维护国家的根本利益，促进经济发展和社会进步。

　　北京医院协会的业务主管单位是北京市卫生健康委员会，依法接受其业务指导；本会的社会团体登记管理机关是北京市民政局，接受其监督管理。